
Konec nelogické dani z tepla, dlouholetý spor je u konce
Celní správa do poslední chvíle objíždí bioplynky a upozorňuje provozovatele, že ještě musí odvést státu poslední poplatek.

Pavel Baroch
29. 7. 2025
Zbývají už jen poslední dny. Od srpna definitivně končí výběr daní z takzvaného bioplynového tepla, čímž se uzavírá několikaletý spor o odvádění poplatku z části produkce bioplynových stanic. V účinnost totiž vstupuje novela energetického zákona označovaná jako Lex OZE III., která nelogický výklad legislativy vyřešila.
„Jsme samozřejmě rádi, že tato přítěž pro bioplynové stanice končí a že se srovnává konkurenční prostředí,“ říká Obnovitelně.cz Jan Habart, předseda Českého sdružení pro biomasu CZ Biom. Kromě toho, že stanice ročně odváděly státu až stovky tisíc korun, to pro ně znamenalo rovněž značnou byrokratickou zátěž.
Problém nastal v roce 2021, kdy přestalo platit osvobození od daně pro pohon motorů. Původně bylo toto opatření zacíleno na využití bioplynu, respektive biometanu v dopravě, jenže celníci podle svého výkladu zákona usoudili, že kogenerační jednotky spalující bioplyn jsou svým způsobem také motor.
Teplo ano, elektřina ne
A od bioplynových stanic s kogenerační jednotkou začali vybírat daň. Ovšem jen za zhruba polovinu vyrobeného bioplynu, která slouží pouze pro výrobu tepla. „Bioplynová elektřina“ zdaněná není. Farmáři a oborové sdružení CZ Biom to pokládají za chybný výklad zákona, a dokonce kvůli tomu vedou několik soudních sporů, které se dostaly až k Nejvyššímu správnímu soudu.
„Zdanění tepla z obnovitelných zdrojů je možná světový unikát,“ vysvětluje pro Obnovitelně.cz Jan Basař, spolumajitel farmy z Podkrkonoší, která vedle tradiční zemědělské produkce provozuje také bioplynovou stanici. Také na ni se před pár lety zaměřila Celní správa, která podniku vyměřovala daň z bioplynového tepla. I pro Farmu Basařovi, která v roce 2022 získala prestižní ocenění Farma roku, tato praxe od srpna končí.
„Po čtyřech letech vymáhání daně na základě podle mého názoru chybného výkladu zákona to bude pro provozovatele bioplynových stanic úleva. A to jak finanční, tak administrativní,“ říká pro Obnovitelně.cz právník
Luděk Šikola z kanceláře Doucha Šikola advokáti, která zastupuje několik nespokojených farmářů ve sporu s Celní
správou.
Podle CZ Biom se stávalo, že Celní správa požadovala zpětné doplacení daně až za tři roky, a to i v případech, kdy byla část bioplynu spotřebována technologicky nebo dodávána do domácností. Jako uznatelné byly zpravidla
akceptovány pouze ty srážky z daně, které byly podloženy měřením.
„Samotný fakt, že ubude jedna z mnoha kontrol na bioplynkách má význam a končí tak výlety krajských celníků po českém venkově. Tím myslím místní šetření, kdy tři celníci autem vyrazili na bioplynovou stanici, aby tam půl dne sepisovali protokol a kladli otázky mimo ekonomickou a provozní realitu,“ dodává Šikola.
Otázkou je, jak se nyní vyvine několik soudních sporů. „Změna zákona funguje do budoucna a na spory s celníky, které se zahájily v minulosti, dopad nemá. Předpokládám, že je dokončíme ať do vítězného, nebo hořkého konce,“
poznamenává právník..
Dodal, že soudy zatím argumentaci proti vyměřování daní z bioplynového tepla nerespektovaly. „Soudní spor je vždycky pro klienta vleklá kapacitní a finanční zátěž. Bude samozřejmě záležet jen na klientech, zda budou chtít
pokračovat,“ uvedl právník.
Celní správa v akci
Právě na prozatímní úspěch u soudů se odvolává Celní správa při argumentaci, že její výklad zákona je správný. „Náš postup potvrdily správní soudy prozatím v pěti případech, zatímco názor odpůrců v nula případech. Soudy shledávají postup, právní názor a závěry Celní správy za bezvadné, logické, konzistentní a souladné s právním řádem a ústavním pořádkem. Jelikož jsou všichni nám známí žalobci zastupováni stejnou advokátní kanceláří, která taktéž zastupuje sdružení CZ Biom, jsou rozsudky v této věci webu Obnovitelně.cz, předpokládáme, známy,“ sdělila před časem mluvčí Celní správy Hana Prudičová.
Podle informací Obnovitelně.cz celníci do posledních dnů objíždějí farmy v krajích a upozorňují provozovatele bioplynových stanic, že za červenec ještě musí příslušnou daň zaplatit. Jejich právní názor ještě utvrdila zmiňovaná novela Lex OZE III., kde autoři schváleného pozměňovacího návrhu zmiňovali nejednoznačný výklad legislativy.
„Navrhovaná úprava nejednoznačný zákon vyjasňuje, když jednoznačně stanoví, že veškerý bioplyn použitý při výrobě elektřiny – nezávisle na tom, zda výrobce využije vzniklé teplo – se považuje za použitý k výrobě elektřiny, a je tím pádem osvobozen od daně podle zákona o stabilizaci veřejných rozpočtů,“ stálo v důvodové zprávě.
Další právní úprava, která začíná od srpna platit, se týká bioplynových stanic vybudovaných v roce 2013. Tehdejší Energetický regulační úřad (ERÚ) pod předsednictvím Aleny Vitáskové totiž změnil metodiku stanovení provozní podpory elektřiny, která vedla ke snížení provozní podpory pro zdroje uvedené do provozu právě v tomto roce.
„Jedním z cílů Lex OZE III. bylo zajistit spravedlivější podmínky pro výrobny elektřiny z obnovitelných zdrojů, které
byly uvedeny do provozu v roce 2013. Tato zařízení budou nově zařazena do režimu čtvrthodinového zeleného bonusu s dorovnáním na úroveň podpory poskytované výrobnám spuštěným v roce 2012,“ uvedl
CZ Biom.
Výrobny tak zůstávají nadále v režimu hodinového zeleného bonusu, který se nově vypočítává ve čtvrthodinových intervalech. Podle aktuálního právního výkladu by operátor trhu měl tuto změnu promítnout do výpočtu výkupní ceny bez nutnosti dalších úprav, například prostřednictvím cenového rozhodnutí.
Úvodní foto: EFG